En los años 1000, el islote sobre el cual esta construido el faro de Cordouan se destacaba de la arena que ha rellenado poco a poco la costa del Medoc. A partir de 1088 unos frailes encendian braseros para guiar los barcos que iban a entrar en Gironde. El "Prince Noir" (Edouard, Principe de Galles), al siglo XIV ordono la edificacion de la primara torre sobre esta isla.
El faro fue reconstruido a la manera de un poderoso palacio al final del siglo XVI por el ingeniero Louis Defoix con orden del rey Henri IV.
El faro coge su forma actual en 1782 con la surelevacion concebida por el celebre ingeniero Teulène.